Горноалтайская порода выведена методом поглотительного скрещивания с козлами придонской породы с последующим разведением “в себе” помесей II и III поколений. При ее выведении применяли также в небольшой степени воспроизводительное скрещивание помесных маток от ангорских и оренбургских козлов, но эффективность была низкая. Горноалтайская порода утверждена в 1982 г. В 1997 г. за работу “Выведение и совершенствование горноалтайской породы пуховых коз” присуждена Государственная премия РФ. Средний начес у маток 550-650 г на 1 голову.