Отдел карантина растений ФГБУ «Омский референтный центр Россельхознадзора» оказывает комплекс услуг в области карантина растений физическим и юридическим лицам в случае ввоза импортной подкарантинной продукции или вывоза импортной и отечественной продукции за пределы Омской области, а также при выращивании, производстве и реализации продукции растительного происхождения. Специалисты отдела карантина растений проводят обследовательские мероприятия полей, лесных насаждений, складов, элеваторов с целью выявления карантинных объектов. В настоящее время специалисты лаборатории карантина растений проводят гербологические, фитогельминтологические, энтомологические и микологические карантинные экспертизы образцов продукции растительного происхождения, идентификацию карантинных и некарантинных вредных организмов, карантинную экспертизу почв на выявление карантинных объектов.
Специалистами отдела карантина растений в 2012 году проанализировано 11074 образца, из них образцы отечественной продукции составили 9456, образцы импортной подкарантинной продукции – 1618. Выдано 5238 заключений в области карантина растений, в это количество входят заключения о фитосанитарном состоянии подкарантинной продукции, заключения о фитосанитарном состоянии подкарантинного объекта, заключения карантинной экспертизы. Проведено 13926 экспертиз из них: энтомологических – 9634; гербологических - 2929; фитогельминтологических – 1363. При проведении карантинных фитосанитарных экспертиз было идентифицировано 14 видов карантинных вредных организмов в 413 случаях. Из них 5 видов энтомологических объектов, такие как: калифорнийская щитовка (Quadraspidiotus peniciosus), тутовая щитовка(Pseudaulacaspis pentagona), западный (калифорнийский) трипс (Frankliniella occidentalis), малый чёрный еловый усач( Monochamus sutor), сибирский шелкопряд (Dendrolimus superans sibiricus). Из гербологических объектов обнаружены карантинные сорняки 8 видов: череда волосистая (Bidens pilosa), горчак ползучий (Acroptilon repens), повилики полевая (Cuscuta campestris), одностолбиковая (Cuscuta monogima), хмелевидная (Cuscuta lupuliformis), амброзии трёхраздельная (Ambrosia trifida) и полыннолистная (Ambrosia artemisiifolia), паслён трёхцветковый (Solanum triflorum). При обследовании земельных участков используемых для выращивания картофеля в почвенных образцах выявлен карантинный вредный объект золотистая картофельная нематода (Globodera rostochiensis). Из некарантинных объектов идентифицировано 2422 случая из 40 видов.