Работу управления возглавляет начальник Главного управления сельского хозяйства Алтайского края - Чеботаев Александр Николаевич
Орган исполнительной власти Алтайского края, осуществляющий государственную аграрную политику и региональное функциональное регулирование, межотраслевую координацию деятельности в агропромышленном комплексе края.
Главное управление сельского хозяйства Алтайского края руководствуется в своей деятельности Конституцией Российской Федерации, Уставом (Основным законом) Алтайского края, законом Алтайского края от 03.11.2005 № 93-ЗС «О системе органов исполнительной власти Алтайского края», федеральным законодательством, законодательством Алтайского края и Положением о Главном управлении сельского хозяйства Алтайского края, утвержденным постановлением Администрации края от 22.05.06г. № 218.
Главное управление осуществляет свою деятельность во взаимодействии с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации, другими федеральными и региональными органами исполнительной власти, органами местного самоуправления, коммерческими и некоммерческими организациями, учреждениями, которые образуют единую систему управления агропромышленным комплексом края.
Основной целью деятельности Главного управления является развитие сельского хозяйства Алтайского края, его производственной и социальной инфраструктуры путем государственного регулирования и координации деятельности отраслей АПК во взаимодействии с другими секторами народного хозяйства и науки.
Задачами Главного управления являются:
разработка и реализация политики государственного регулирования сельского хозяйства, производства ресурсов, развитие производственной и социальной инфраструктуры;
обеспечение сбалансированного развития отраслей агропромышленного комплекса;
осуществление мероприятий по рациональному и эффективному использованию земли, основных фондов, материальных и финансовых ресурсов, улучшению качества и снижению себестоимости продукции, повышению рентабельности производства, своевременному выполнению квот по поставкам продукции в федеральный и региональный фонды.