На протяжении 16 веков нашей эры, особенно начиная со II в., господствовали религиозно-мистические представления о явлениях в живой природе. Этот период схоластики оставил нам лишь описания некоторых болезней лекарственных растений.
Для XVI — XVIII вв. характерны миколого-флористические исследования, в результате которых появляются ссылки на паразитические грибы. При этом они рассматривались как экссудаты или выделения самих растений, согласно господствовавшей в то время теории экзантем (сыпей).